Les produits végétaux poussant dans la terre peuvent couramment être contaminés par les Salmonelles d’origine animale ; il a même été rapporté des cas de salmonelloses par ingestion d’amandes polluées au moment de la floraison. Les Listeria étant des germes de l’environnement sont classiquement retrouvées sur les légumes verts et les salades : la réglementation sur la recherche de ces germes pathogènes s’applique donc aux végétaux .
Les végétaux en provenance de pays tropicaux ou conservés dans des conditions de température et d’humidité élevées sont eux susceptibles de contenir des Mycotoxines produites par les champignons et moisissures dont le développement a été ainsi favorisé ; leurs propriétés potentiellement cancérigènes rendent leur détection indispensable.
Enfin la consommation de certaines céréales pouvant entrainer des réactions allergiques, il est aujourd’hui exigé de détecter leur présence dans les aliments qui en contiennent.
